大豆過敏症通常發生於嬰幼兒和兒童時期，但很多人會在五歲後自然痊癒。食物過敏症的反應通常吃了致敏食物後，在幾分鐘至幾小時後出現過敏症狀。症狀的嚴重程度因個人而異。輕度過敏的人可能出現瘙癢和紅疹，而嚴重過敏的人可能會遇到較嚴重的症狀，如呼吸困難或喉嚨腫脹等。

要避免產生過敏反應，最主要是避免進食大豆或含大豆成分的製品。

但有研究指，對大豆過敏的人可放心進食大豆卵磷脂和大豆油。建議過敏人士必需仔細閱讀食品包裝上的成分表，而出外飲食也不防問清楚菜式是否含有大豆成分，檢查清楚有沒有大豆成分才安全食用。

痛風症是因為身體內含有過多的尿酸，尿酸鹽就會聚於關節內，引起發炎疼痛。我們在日常飲食中，若進食一些含高成份「普林」的食物，「普林」在我們體內經過新陳代謝後，就會變成尿酸。有些人的新陳代謝受到遺傳因素影響，體內會傾向於產生過量的尿酸，再加上暴飲暴食，便很容易誘發痛風症。

大豆的「普林」含量高，罹患痛風的人士應小心進大豆製品。大豆經過加工後，普林會被稀釋，例如製造豆腐和豆漿之後，普林質就被稀釋到原來的十分之一含量。只要少量進食，對痛風患者並沒有影響。

因大豆製品亦含豐富蛋白質，過量攝取蛋白質也會誘發痛風症，例如每300克豆腐便含有相等於一塊手掌般大的豬扒所含的蛋白質。所以吃大豆製品的同時要減少吃其他肉類、魚類、海產和家禽等。

大豆中的異黃酮具有弱雌激素的活性(estrogen-like activity)，一些研究指認為它們能作為抗雌激素，減少癌細胞的生長，而其則認為它們的雌激素樣活性，也可能會導致癌症。美國癌症協會專家建議，現服用乳癌化療藥如 Tamoxifen 或 Aromatase inhibitors 的病患者，應該避免大量進食大豆，包括大豆補充劑或大豆異黃酮。